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Text File  |  1995-03-04  |  2.7 KB  |  60 lines
  1. ************************************************
  2. * Interleukin-6 / G-CSF / MGF family signature *
  3. ************************************************
  4.  
  5. The following cytokines  can  be grouped  into a single family on the basis of
  6. sequence similarities.
  7.  
  8.  - Interleukin-6 (IL-6) [1] (also known as B-cell stimulatory factor 2 (BSF-2)
  9.    or interferon beta-2) is a cytokine that has a wide variety  of  biological
  10.    functions.  It  plays  an essential role in the final differentiation of B-
  11.    cells into  IG-secreting    cells, as well as inducing myeloma/plasmacytoma
  12.    growth, nerve    cell  differentiation  and,  in   hepatocytes, acute phase
  13.    reactants.
  14.  - Granulocyte  colony-stimulating  factor (G-CSF) [2] belongs to the cytokine
  15.    family whose  members  regulate   hematopoietic   cell   proliferation  and
  16.    differentiation. G-CSF  exclusively  stimulates  the  colony  formation  of
  17.    granulocytes.
  18.  - Myelomonocytic growth factor (MGF) [3]  is  an  avian  hematopoeitic growth
  19.    factor that stimulates the proliferation and colony formation of normal and
  20.    transformed avian cells of the myeloid lineage.
  21.  
  22. These cytokines are glycoproteins of about 170 to 180 amino acid residues that
  23. contains four conserved cysteine residues involved in two disulfide bonds [4],
  24. as shown in the following schematic representation.
  25.  
  26.                        +--+     +---+
  27.                        |  |     |   |
  28.             xxxxxxxxxxxCxxCxxxxxCxxxCxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
  29.                                 **********
  30.  
  31. 'C': conserved cysteine involved in a disulfide bond.
  32. '*': position of the pattern.
  33.  
  34. The pattern  developed  for  this  family  of  proteins  includes the last two
  35. cysteines as well as other conserved residues.
  36.  
  37. -Consensus pattern: C-x(9)-C-x(6)-G-L-x(2)-[FY]-x(3)-L
  38.                     [The two C's are involved in disulfide bonds]
  39. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  40. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  41.  
  42. -Note: it has been said [5] that this family can be extended by the adjunction
  43.  of LIF and OSM (see the relevant section) but, while all these cytokines seem
  44.  to be structurally related,  the  sequence  similarity  is not high enough to
  45.  allow the use of only one single consensus pattern.
  46.  
  47. -Last update: June 1994 / Text revised.
  48.  
  49. [ 1] Kishimoto T., Hirano T.
  50.      BioEssays 9:11-15(1988).
  51. [ 2] Metcalf D.
  52.      Science 229:16-22(1985).
  53. [ 3] Leutz A., Damm K., Sterneck E., Kowenz E., Ness S., Frank R.,
  54.      Gausepohl H., Pan Y.-C.E., Smart J., Hayman M., Graf T.
  55.      EMBO J. 8:175-181(1989).
  56. [ 4] Clogston C.L., Boone T.C., Crandall B.C., Mendiaz E.A., Lu H.S.
  57.      Arch. Biochem. Biophys. 272:144-151(1989).
  58. [ 5] Rose T.M., Bruce A.G.
  59.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88:8641-8645(1991).
  60.